Молекулы никогда не стоят на месте

Молекулы никогда не стоят на месте. Белки меняют форму, ферменты захватывают свои субстраты, вирусы находят рецепторы на поверхности клеток — и все это происходит в масштабах, недоступных человеческому глазу.

И все же сегодня мы можем наблюдать эти процессы. Благодаря молекулярной динамике ученые создают компьютерные модели, которые позволяют понять и увидеть, как взаимодействуют отдельные атомы и молекулы и буквально заглянуть в жизнь клетки на атомном уровне.

На видео — результат такого расчёта: взаимодействие рецептора ACE2 с S-белком коронавируса. Именно через этот рецептор вирус проникает в клетки человека. Молекулярная динамика позволяет увидеть этот процесс в движении — с детализацией, недоступной даже современным экспериментальным методам структурной биологии.

Но как вообще удается рассчитать движение миллионов атомов? Какие вычислительные мощности для этого нужны? И как путь от компьютеров размером с комнату привел к тому, что сегодня подобные расчеты можно запускать чуть ли не с личного ноутбука? Рассказываем об этом в новой статье «Молекулярная динамика биомолекул. Часть III: от перфокарт до ИИ».

#Биомолекула_Инфографика никогда не стоят на месте. Белки меняют форму, ферменты захватывают свои субстраты, вирусы находят рецепторы на поверхности клеток — и все это происходит в масштабах, недоступных человеческому глазу.

И все же сегодня мы можем наблюдать эти процессы. Благодаря молекулярной динамике ученые создают компьютерные модели, которые позволяют понять и увидеть, как взаимодействуют отдельные атомы и молекулы и буквально заглянуть в жизнь клетки на атомном уровне.

На видео — результат такого расчёта: взаимодействие рецептора ACE2 с S-белком коронавируса. Именно через этот рецептор вирус проникает в клетки человека. Молекулярная динамика позволяет увидеть этот процесс в движении — с детализацией, недоступной даже современным экспериментальным методам структурной биологии.

Но как вообще удается рассчитать движение миллионов атомов? Какие вычислительные мощности для этого нужны? И как путь от компьютеров размером с комнату привел к тому, что сегодня подобные расчеты можно запускать чуть ли не с личного ноутбука? Рассказываем об этом в новой статье «Молекулярная динамика биомолекул. Часть III: от перфокарт до ИИ»: https://biomolecula.ru/articles/molekuliarnaia-dinamika-biomolekul-chast-iii-ot-perfokart-do-ii

Телеграм: t.me/ainewsline

Источник: biomolecula.ru

Комментарии: