Командная строка вместо пробирки – биоинформатик из Пущино стал лауреатом премии губернатора для молодых учёных

Ведущий научный сотрудник группы регуляции биосинтеза белка Института белка РАН Иван Кулаковский стал лауреатом премии губернатора Московской области в сфере науки, технологий, техники и инноваций.

Биоинформатик, доктор биологических наук и кандидат физико-математических наук, выпускник Московского государственного университета леса пришёл в науку из сферы разработки программного обеспечения.

Сегодня он раскрывает тайны генома человека. Вместо эффектных опытов в лабораторных колбах и выращивания в чашках Петри — программирование и работа в командной строке.

Учёный с коллегами пытается разгадать механизм, управляющий работой генов: какие последовательности и как именно включают и выключают гены и определяют удивительные различия между тканями и органами человека и предрасположенность к заболеваниям.

Геном человека был прочитан больше 20 лет назад, за это время исследователи получили представление о его структуре. Всего 1–2% всей ДНК человека приходится на кодирующие гены, эти участки изучены лучше всего.

За пределами этих небольших островков обширная загадочная территория, где можно обнаружить массу интересного: остатки вирусов, участки ДНК, которые остались от предков и отражают историю эволюции, участки, регулирующие работу генов. Задача учёных — создать максимально подробный атлас генома. Работа Ивана и его команды уже много лет сфокусирована на «разделе», посвящённом генной регуляции — регуляторной геномике.

Это особенно важно для медицины: понимание принципов регуляции генов помогает прогнозировать индивидуальную предрасположенность к болезням и разрабатывать персонализированные методы лечения, включая перспективную РНК-терапию.

Ещё одна важная задача, которую ставят перед собой биоинформатики — создание баз данных, которые становятся фундаментом для современных исследований.

Одним из достижений Кулаковского и его коллег стало создание уникального каталога регуляторных сигналов — базы данных, формирование которой заняло более десяти лет. Она стала самой цитируемой российской базой данных молекулярной биологии в мире. Сегодня её используют в генетике, биоинформатике, молекулярной биологии.

Сейчас Иван и его ученики — участники уникального проекта, посвящённого генной регуляции в скелетных мышцах человека. Учёные рассчитывают в ближайшем будущем сделать эти данные общедоступными, что откроет новые возможности для науки и медицины. Например, поможет врачам-генетикам, ведущим пациентов с патологиями мышц.

Источник: vk.com

Комментарии: