Alexa, а что там p53?

Ученые представили виртуального помощника Melvin, который дает возможность запрашивать разнообразную информацию по геномике рака голосом! ?

Секвенирование позволило собрать обширные объемы данных по онкогеномике, однако их использование в клинике затруднено. Врачи, многие из которых не знают биоинформатики, хотят иметь под рукой интуитивно понятные инструменты, без погружения в технические нюансы. Все привыкли к графическим интерфейсам, однако вбивать руками запросы тоже непросто. Поэтому лаборатория Джейсона Питта из Национального университета Сингапура разработала голосовой интерфейс, который позволяет спрашивать о геномике рака на естественном языке и в ходе диалога получать оперативные ответы.

К Melvin можно обратиться через любое устройство «умного дома», поддерживающее Amazon Alexa. Он содержит информацию о 33 типах рака из базы данных Атласа генома рака (TCGA) и другие дополнительные наборы. Melvin оперирует тремя атрибутами: ген, тип рака, тип данных. Пользователи могут задавать вопросы о соматических мутациях, вариациях числа копий, уровнях экспрессии генов.

Понятно, что одним предложением сформулировать вопрос о геномике и мутациях невозможно. Поэтому Melvin поддерживает диалоговый процесс и «натренирован» постепенно уточнять интересующие вещи — он запоминает контекст. Например, можно попросить: «Расскажи мне о мутациях». Потом: «Покажи мне рак молочной железы». Затем: «Какова частота мутаций PIK3CA?» Melvin отвечает голосом, выводит статистику на экран, рисует понятные графики (кстати, не без помощи Python). И, если надо, мгновенно отправит результаты на электронную почту. А еще создатели предусмотрели краудсорсинговый веб-портал, где каждый может добавлять аудио со своим произношением названий генов для улучшения качества распознавания речи ?

Диалоговый агент Melvin призван облегчить работу исследователей и онкологов по интерпретации данных секвенирования опухолей. Буквально: скоро будем слушать о геномике из каждого утюга! ?

Источник: vk.com

Комментарии: