Ковидные войны: Новая надежда? |
||
МЕНЮ Искусственный интеллект Поиск Регистрация на сайте Помощь проекту ТЕМЫ Новости ИИ Искусственный интеллект Разработка ИИГолосовой помощник Городские сумасшедшие ИИ в медицине ИИ проекты Искусственные нейросети Слежка за людьми Угроза ИИ ИИ теория Внедрение ИИКомпьютерные науки Машинное обуч. (Ошибки) Машинное обучение Машинный перевод Нейронные сети начинающим Реализация ИИ Реализация нейросетей Создание беспилотных авто Трезво про ИИ Философия ИИ Big data Работа разума и сознаниеМодель мозгаРобототехника, БПЛАТрансгуманизмОбработка текстаТеория эволюцииДополненная реальностьЖелезоКиберугрозыНаучный мирИТ индустрияРазработка ПОТеория информацииМатематикаЦифровая экономика
Генетические алгоритмы Капсульные нейросети Основы нейронных сетей Распознавание лиц Распознавание образов Распознавание речи Техническое зрение Чат-боты Авторизация |
2020-11-20 22:05 Пока производители вакцин меряются эффективностью своих прививок, ученые не сидят на месте и разрабатывают новые методы борьбы с COVID-19. Один из них заслужил особый интерес научного сообщества, ведь, судя по последним исследованиям, он сможет защитить нас от коронавирусной инфекции даже тогда, когда перестанет работать долгожданная вакцина. А рано или поздно, это произойдет. Да, вакцины – отличный способ предотвратить эпидемию, ведь они помогают нам выработать иммунный ответ против вируса еще до встречи с ним. Однако, как мы уже убедились, коронавирус SARS-CoV-2 мутирует - пусть и не так быстро, как вирус гриппа. А значит, со временем он уйдет из-под радара иммунитета и сможет заражать нас с новой силой, не жалея даже привитых. Более того, речь не о каком-то далеком будущем. Уже сегодня обнаружены мутантные формы SARS-CoV-2, которые не удается нейтрализовать антителами, защищающими нас от других его штаммов [1]. В связи с этим было бы здорово иметь лекарство, которое бы спасало нас от COVID-19 вне зависимости от того, как мутирует коронавирус. Пусть не профилактически, но хотя бы после заражения. Но где же его найти? Для ответа обратимся к жизненному циклу SARS-CoV-2. Первое, что должен сделать вирус для успешного заражения – попасть внутрь клеток. Главными воротами, через которые это делает наш новый знакомый, служит белок ACE2, расположенный на поверхности наших клеток. Шиповидный белок SARS-CoV-2 с удовольствием связывается с этим рецептором, в результате чего ворота раскрываются, впуская вирус внутрь (рис. 1). Получается, ACE2 – наше слабое место, которым раз за разом успешно пользуется коронавирус. Но что, если превратить этот недостаток в преимущество? Рецепт инновационного лекарства очень прост: ввести в кровь зараженному пациенту дополнительные копии белка ACE2. Причем, можно даже не целиком, а только ту часть, которой он взаимодействует с вирусом. В этом случае добавленные рецепторы, как антитела, свяжут шипики коронавируса и не дадут ему атаковать наши клетки. Мы буквально ловим вирус на живца: в поисках дверей в клетку он раз за разом будет натыкаться на расставленные нами мышеловки (рис. 2). И действительно, эксперименты на клетках и тканях человека показали, что добавление белка ACE2 надежно нейтрализует SARS-CoV-2, мешая ему инфицировать наши клетки [2]. Бонусом мы получаем и другой приятный эффект. Дело в том, что рецептор ACE2 в нашем организме выполняет и вполне конкретную функцию – расщепляет гормон ангиотензин II. Этот гормон провоцирует гипертензию (повышенное артериальное давление), воспаление и цитокиновый шторм – один из главных факторов летального исхода у больных COVID-19. Введение больному дополнительных копий ACE2 может снизить уровень ангиотензина II и, как следствие, подавить воспалительный ответ и облегчить течение заболевания (рис. 2). И действительно, этот прогноз подтвердился учеными в ходе клинических испытаний. Уже на следующий день после введения экспериментального лекарства пациентке с COVID-19 уровень цитокинов в ее крови упал вдвое, а одновременно с этим и количество вирусных частиц SARS-CoV-2 [3]. Итак, ACE2 действительно подает большие надежды как новое лекарство против коронавирусной инфекции. Но насколько хорошо оно проявит себя на практике? Это мы узнаем по итогам клинических испытаний. Безопасность применения ACE2 у здоровых людей была подтверждена результатами первой фазы испытаний еще в 2013 году (предвосхищая теории заговора: тогда оно рассматривалось для лечения другого респираторного заболевания) [4]. Теперь дело – за эффективностью. Вторая фаза испытаний ACE2 против COVID-19 уже запущена. Результаты ожидаются в декабре этого года, так что ждать осталось совсем недолго [5]. Но ученые и не думали останавливаться на достигнутом. Дело в том, что у этой терапии есть один недостаток: белок ACE2 не очень крепко связывается с коронавирусом – примерно в 100 раз хуже, чем антитела. Поэтому, чтобы нейтрализовать вирус, требуются очень большие дозы рецептора. Можем ли мы улучшить нашу мышеловку и сделать так, чтобы она «захлопывала» SARS-CoV-2 не хуже антител? Этому и посвящены новые работы в журналах Science [6] и PNAS [7]. В них ученые добавляли единичные мутации в структуру рецептора ACE2, чтобы он гораздо прочнее связывался с шипиком вируса и, как следствие, нейтрализовал его при более низких концентрациях. В первой работе ученые применили метод грубой силы и по одной ввели все возможные мутации в фрагмент белка ACE2, а затем посмотрели, какие из мутаций лучше всего свяжут его с вирусом. Во втором исследовании за ту же задачу взялись биоинформатики. Вместо того, чтобы делать эксперимент в пробирке, они провернули то же самое на компьютере. Да, благодаря методам молекулярного моделирования мы научились неплохо предсказывать, как повлияет та или иная мутация на взаимодействие между белками. Для этого в лаборатории не нужно иметь даже сам изучаемый белок. Экспериментальный и биоинформатический методы привели к сопоставимым и весьма обнадеживающим результатам. Введение всего 3 мутаций привело к тому, что рецепторы ACE2 стали связываться с шиповидным белком вируса в десятки раз лучше (рис. 3). Ну а главное, улучшенные по итогу мышеловки смогли нейтрализовать коронавирус SARS-CoV-2 в 1000 раз лучше, чем исходные! Теперь по терапевтической дозе новое лекарство ничем не уступает антителам! Но это были цветочки, а теперь – о главном преимуществе нового лекарства. В отличие от антител и вакцин, оно практически не имеет срока годности. Да, против такой ловушки вирусу не помогут даже мутации. Представим, что SARS-CoV-2 мутировал и перестал связываться с рецепторами ACE2, плавающими в крови. Но тогда те же мутации помешают ему связаться и с рецепторами на поверхности клетки (ведь лекарство и ворота в клетку – это один и тот же белок). Таким образом, обойдя мышеловку, вирус одновременно потеряет способность нас инфицировать. Получается, мы в любом случае в плюсе. Для того, чтобы доказать универсальность лекарства, ученые проверили, насколько хорошо оно сможет нейтрализовать другой коронавирус – SARS-CoV-1. Этот вирус вызвал вспышку атипичной пневмонии в 2003 и является дальним родственником нашего нового знакомого. Генетически они схожи на 75%, примерно как человек и … карп. Да, не самая близкая родня. Тем не менее, новое улучшенное лекарство защищало клетки и от этого коронавируса, причем так же успешно, как и от самого SARS-CoV-2 (рис. 4). Выходит, накопив даже тысячу мутаций (а примерно столько мутаций разделяет шиповидные белки SARS-CoV-1 и SARS-CoV-2), вирус вряд ли сможет обхитрить лекарство на основе ACE2. Таким образом, наш арсенал методов борьбы с коронавирусом пополняется с каждым месяцем. Одни подходы помогут нам отразить атаку при первом же появлении вируса в организме, другие – избавят от него, даже если он обойдет нашу иммунную систему. Насколько эффективен тот и другой подход – покажут результаты клинических испытаний всего через несколько месяцев. Ну а пока мы можем только надеяться. Впрочем, даже если что-то пойдет не так, со временем появятся новые научные исследования, а с ними – и новая надежда. Источники: 1. Thompson, E. et al. The circulating SARS-CoV-2 spike variant N439K maintains fitness while evading antibody-mediated immunity. BioRxiv (2020) 2. Monteil, V. et al. Inhibition of SARS-CoV-2 Infections in Engineered Human Tissues Using Clinical-Grade Soluble Human ACE2. Cell (2020) 3. Zoufaly, A. et al. Human recombinant soluble ACE2 in severe COVID-19. The Lancet Respiratory Medicine (2020) 4. Haschke, M. et al. Pharmacokinetics and pharmacodynamics of recombinant human angiotensin-converting enzyme 2 in healthy human subjects. Clinical Pharmacokinetics (2013) 5. ClinicalTrials Identifier: NCT04335136. Recombinant Human Angiotensin-converting Enzyme 2 (rhACE2) as a Treatment for Patients With COVID-19 (APN01-COVID-19) 6. Chan, D. et al. Engineering human ACE2 to optimize binding to the spike protein of SARS coronavirus 2. Science (2020) 7. Glasgow, A. et al. Engineered ACE2 receptor traps potently neutralize SARS-CoV-2. Proceedings of the National Academy of Sciences (2020) Комментарии: |
|