Биоинформатики из Германии разработали пакет Biotide для работы с биологическими данными в Python
МЕНЮ
Искусственный интеллект
Поиск
Регистрация на сайте
Помощь проекту
ТЕМЫ
Новости ИИ
Голосовой помощник
Городские сумасшедшие
ИИ в медицине
ИИ проекты
Искусственные нейросети
Слежка за людьми
Угроза ИИ
Компьютерные науки
Машинное обуч. (Ошибки)
Машинное обучение
Машинный перевод
Реализация ИИ
Реализация нейросетей
Создание беспилотных авто
Трезво про ИИ
Философия ИИ
Генетические алгоритмы
Капсульные нейросети
Основы нейронных сетей
Распознавание лиц
Распознавание образов
Распознавание речи
Техническое зрение
Чат-боты
Авторизация
2019-01-18 14:34
Биоинформатики из Германии разработали пакет Biotide для работы с биологическими данными в Python на основе NumPy массивов. Это программное обеспечение объединяет в себе возможности Biopython, MDAnalysis and MDTraj, позволяет работать с последовательностями нуклеотидов (выравнивать, аннотировать, строить филогенетические деревья) и данными макромолекулярных структур (измерять расстояния, углы и двугранные углы между отдельными атомами, массивами атомов, определять RMSF и SASA).
Biotide отличается простотой в использовании и подойдёт для начинающих биоинформатиков. Разработчики также позаботились о туториалах по обучению работы с программой.
Статья: https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s12859-018-2367-z
Репозиторий: https://github.com/biotite-dev/biotit
Источник: github.com