Технология CRISPR вызывает сотни незапланированных мутаций в геноме

Новое исследование, опубликованное в журнале Nature Methods, обнаружило, что технология генной инженерии CRISPR/Cas9 может стать причиной сотен незапланированных мутаций в геноме.

«Мы считаем важным, чтобы научное сообщество осознало потенциальную угрозу случайных мутаций, вызванных CRISPR, включая мутации одного нуклеотида и мутации некодирующих регионов генома», — говорит соавтор статьи профессор Стивен Цзан.

Технология редактирования генома CRISPR/Cas9, благодаря своей скорости и непревзойденной точности, оказывает неоценимую помощь ученым, исследующим роль генов в развитии заболеваний. Кроме того, она позволяет надеяться на появление более эффективных видов лечения, связанных с удалением или восстановлением поврежденных генов.

В Китае уже идет первое клиническое испытание CRISPR, в США оно назначено на будущий год. Но даже несмотря на то, что эта технология способна точно отделить интересующий ученого участок ДНК, иногда она захватывает и другие части генома.

Компьютерные алгоритмы неплохо справляются с поиском таких областей в клетках или тканях, когда исследования ведутся в пробирке, но в живом организме пришлось бы ради этого делать полное секвенирование генома, говорит профессор Университета Айовы Александр Бассюк.

В целях эксперимента ученые так и сделали, полностью исследовав геном мышей, прошедших генетическое редактирование, чтобы найти все мутации, включая те, которые изменили всего один нуклеотид. В результате было обнаружено более 1500 мутаций одного нуклеотида и более 100 крупных вставок или удалений. Ни одно из них не было замечено компьютерным алгоритмом, пишет Phys.org.

«Исследователи, не применяющие полное секвенирование для обнаружения случайных эффектов, могут пропустить потенциально важные мутации, — говорит Цзан. — Даже изменение одного нуклеотида может иметь огромное влияние».

Cпособ следить за генами в реальном времени открыли ученые из Университета Виргинии. Они отмечают интересующие их области флуоресцентным белком, а после используют CRISPR для томографии хромосом. Это позволяет наблюдать за генами в трех измерениях внутри живой клетки.

Источник: hightech.fm

Комментарии: